Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.

Publikace ASEP

Označit vše / Zobrazit vše / Zrušit označení

Nalezeno záznamů: 269

0474432 - UOCHB-X 2018 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Adla, Santosh Kumar - Slavíková, Barbora - Šmídková, Markéta - Tloušťová, Eva - Svoboda, Martin - Vyklický, Vojtěch - Krausová, Barbora - Hubálková, Pavla - Nekardová, Michaela - Holubová, Kristina - Valeš, Karel - Buděšínský, Miloš - Vyklický ml., Ladislav - Chodounská, Hana - Kudová, Eva
Physicochemical and biological properties of novel amide-based steroidal inhibitors of NMDA receptors.
Steroids. Roč. 117, Jan (2017), s. 52-61 ISSN 0039-128X.
[Conference on Isoprenoids /23./. Minsk, 04.09.2016-07.09.2016]
Grant CEP: GA TA ČR(CZ) TE01020028; GA ČR(CZ) GAP303/12/1464; GA MŠk LO1302; GA MZd(CZ) NV15-29370A; GA ČR(CZ) GBP208/12/G016
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:67985823
Klíčová slova: neurosteroid * NMDA receptor * structure-activity relationship * amide * blood-brain-barrier permeability * Caco-2 assay
Kód oboru RIV: CC - Organická chemie
Impakt faktor: 2.282, rok: 2016
Kudová, Eva
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0271487

0474988 - UOCHB-X 2018 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Agrawal, K. - Das, V. - Otmar, Miroslav - Krečmerová, Marcela - Džubák, P. - Hajdúch, M.
Cell-based DNA demethylation detection system for screening of epigenetic drugs in 2D, 3D, and xenograft models.
Cytometry. Part A. 91A, č. 2 (2017), s. 133-143 ISSN 1552-4922
Grant CEP: GA MZd(CZ) NV15-31984A; GA MŠk(CZ) LO1304; GA MŠk(CZ) LM2015064; GA TA ČR(CZ) TE01020028
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: DNA methylation * DNA methylation inhibitors * demethylation detection system * epigenetic drugs * high content screening
Kód oboru RIV: CC - Organická chemie
Impakt faktor: 3.222, rok: 2016
Hajdúch, M.
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0271874

0478165 - UOCHB-X 2018 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Alves, A. C. - Magarkar, Aniket - Horta, M. - Lima, J. L. F. C. - Bunker, A. - Nunes, C. - Reis, S.
Influence of doxorubicin on model cell membrane properties: insights from in vitro and in silico studies.
Scientific Reports. Roč. 7, Jul 24 (2017), č. článku 6343. ISSN 2045-2322
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: P-glycoprotein * molecular dynamics * multidrug resistance
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 4.259, rok: 2016
https://www.nature.com/articles/s41598-017-06445-z
Nunes, C.
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0274354

0475192 - UOCHB-X 2018 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Amatov, Tynchtyk - Pohl, Radek - Císařová, I. - Jahn, Ullrich
Sequential Oxidative and Reductive Radical Cyclization Approach toward Asperparaline C and Synthesis of Its 8-Oxo Analogue.
Organic Letters. Roč. 19, č. 5 (2017), s. 1152-1155 ISSN 1523-7060
COST(XE) CM1201
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: prenylated indole alkaloids * chiral tetracyclic indolidines * Aspergillus japonicus JV-23
Kód oboru RIV: CC - Organická chemie
Impakt faktor: 6.579, rok: 2016
http://pubs.acs.org/doi/full/10.1021/acs.orglett.7b00187
Jahn, Ullrich
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0272047

0480196 - UOCHB-X 2018 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Andrei, G. - Carter, K. - Janeba, Zlatko - Sampath, A. - Schang, L. M. - Tarbet, E. B. - Vere Hodge, R. A. - Bray, M. - Esté, J. A.
Highlights of the 30th International Conference on Antiviral Research.
Antiviral Research. Roč. 145, Sep (2017), s. 184-196 ISSN 0166-3542
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: chronic hepatitis C * dengue virus * in vitro
Kód oboru RIV: CC - Organická chemie
Impakt faktor: 4.271, rok: 2016
Esté, J. A.
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0276074

0481007 - UOCHB-X 2018 US eng J - Článek v odborném periodiku
Bacci, M. - Vymětal, Jiří - Mihajlovic, M. - Caflisch, A. - Vitalis, A.
Amyloid beta Fibril Elongation by Monomers Involves Disorder at the Tip.
Journal of Chemical Theory and Computation. Roč. 13, č. 10 (2017), s. 5117-5130 ISSN 1549-9618
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: molecular dynamics simulations * atomic resolution structure * A beta
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 5.245, rok: 2016
Caflisch, A.
- Vitalis, A.
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0276662

0483182 - UOCHB-X 2018 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Bacci, M. - Langini, C. - Vymětal, Jiří - Caflisch, A. - Vitalis, A.
Focused conformational sampling in proteins.
Journal of Chemical Physics. Roč. 147, č. 19 (2017), č. článku 195102. ISSN 0021-9606
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: molecular dynamics simulations * histone recognition * fibril elongation
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 2.965, rok: 2016

Bacci, M. Caflisch, A.
- Vitalis, A.
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0278576

0482517 - UOCHB-X 2018 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Balintová, Jana - Simonova, Anna - Bialek-Pietras, M. - Olejniczak, A. - Lesnikowski, Z. J. - Hocek, Michal
Carborane-linked 2'-deoxyuridine 5'-O-triphosphate as building block for polymerase synthesis of carborane-modified DNA.
Bioorganic and Medicinal Chemistry Letters. Roč. 27, č. 21 (2017), s. 4786-4788 ISSN 0960-894X
Grant CEP: GA ČR GBP206/12/G151
AV ČR(CZ) AP1501
Akademická prémie - Praemium Academiae
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: nucleotides * nucleoside triphosphates * carboranes * DNA polymerase * oligonucleotides
Kód oboru RIV: CC - Organická chemie
Impakt faktor: 2.454, rok: 2016
Lesnikowski, Z. J.
- Hocek, Michal
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0277943

0481074 - UOCHB-X 2018 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Barauskas, O. - Xing, W. - Aguayo, E. - Willkom, M. - Sapre, A. - Clarke, M. - Birkuš, Gabriel - Schultz, B. E. - Sakowicz, R. - Kwon, H. J. - Feng, J. Y.
Biochemical characterization of recombinant influenza A polymerase heterotrimer complex: Polymerase activity and mechanisms of action of nucleotide analogs.
PLoS ONE. Roč. 12, č. 10 (2017), č. článku e0185998. E-ISSN 1932-6203
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: virus RNA polymerase * T-705 Favipiravir * structural basis
Kód oboru RIV: CE - Biochemie
Impakt faktor: 2.806, rok: 2016
http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0185998
Kwon, H. J.
- Feng, J. Y.
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0276683

0480814 - UOCHB-X 2018 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Bártová, Kateřina - Čechová, Lucie - Procházková, Eliška - Socha, Ondřej - Janeba, Zlatko - Dračínský, Martin
Influence of Intramolecular Charge Transfer and Nuclear Quantum Effects on Intramolecular Hydrogen Bonds in Azopyrimidines.
Journal of Organic Chemistry. Roč. 82, č. 19 (2017), s. 10350-10359 ISSN 0022-3263
Grant CEP: GA ČR GA15-11223S
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: pyrimidines * NMR spectroscopy * DFT calculations
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 4.849, rok: 2016
Dračínský, Martin
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0276495

0474811 - UOCHB-X 2018 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Barvík, I. - Rejman, Dominik - Panova, Natalya - Šanderová, Hana - Krásný, Libor
Non-canonical transcription initiation: the expanding universe of transcription initiating substrates.
FEMS Microbiology Reviews. Roč. 41, č. 2 (2017), s. 131-138 ISSN 0168-6445
Grant CEP: GA ČR GA15-05228S; GA ČR GA15-11711S
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:61388971
Klíčová slova: RNA polymerase * non-canonical transcription initiation * transcription initiating substrate * nicotinamide adenine dinucleotide (NAD(+)) * coenzymes * RNA stability
Kód oboru RIV: EB - Genetika a molekulární biologie
Impakt faktor: 12.198, rok: 2016
Krásný, Libor
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0271763

0478540 - UOCHB-X 2018 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Becucci, M. - Mazzoni, F. - Pietraperzia, G. - Řezáč, Jan - Nachtigallová, Dana - Hobza, Pavel
Non-covalent interactions in anisole-(CO2)(n) (n=1, 2) complexes.
Physical Chemistry Chemical Physics. Roč. 19, č. 34 (2017), s. 22749-22758 ISSN 1463-9076
Grant CEP: GA ČR(CZ) GBP208/12/G016
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: density functional theory * anisole-water complex * equation of state
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 4.123, rok: 2016
Becucci, M.
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0274639

0474386 - UOCHB-X 2018 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Beier, Petr
Synthesis and reactivity of novel sulfur pentafluorides-Effect of the SF5 group on reactivity of nitrobenzenes in nucleophilic substitution.
Phosphorus. Sulfur and Silicon. Roč. 192, č. 2 (2017), s. 212-215 ISSN 1042-6507.
[International Symposium on the Organic Chemistry of Sulfur (ISOCS) /27./. Jena, 26.07.2016-29.07.2016]
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: nucleophilic substitution * sulfur * fluorine * reaction rate
Kód oboru RIV: CC - Organická chemie
Impakt faktor: 0.809, rok: 2016
Beier, Petr
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0271448

0474778 - UOCHB-X 2018 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Beljantseva, J. - Kudrin, P. - Jimmy, S. - Ehn, Marcel - Pohl, Radek - Varik, V. - Tozawa, Y. - Shingler, V. - Tenson, T. - Rejman, Dominik - Hauryliuk, V.
Molecular mutagenesis of ppGpp: turning a RelA activator into an inhibitor.
Scientific Reports. Roč. 7, Feb 3 (2017), č. článku 41839. ISSN 2045-2322
Grant CEP: GA ČR GA15-11711S
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: antibiotics * enzymes * bacterial stringent response * small molecules
Kód oboru RIV: CE - Biochemie
Impakt faktor: 4.259, rok: 2016
https://www.nature.com/articles/srep41839
Rejman, Dominik
- Hauryliuk, V.
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0271729

0475623 - UOCHB-X 2018 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Benkovičová, Monika - Wen, D. - Plutnar, Jan - Čížková, Martina - Eychmüller, A. - Michl, Josef
Mechanism of Surface Alkylation of a Gold Aerogel with Tetra-n-butylstannane-d(36): Identification of Byproducts.
Journal of Physical Chemistry Letters. Roč. 8, č. 10 (2017), s. 2339-2343 ISSN 1948-7185
Grant CEP: GA ČR GA14-02337S
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: self-assembled monolayers
Kód oboru RIV: CC - Organická chemie
Impakt faktor: 9.353, rok: 2016
Michl, Josef
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0272297

0478453 - UOCHB-X 2018 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Benoni, Roberto - Beck, C. M. - Garza-Sánchez, F. - Bettati, S. - Mozzarelli, A. - Hayes, C. S. - Campanini, B.
Activation of an anti-bacterial toxin by the biosynthetic enzyme CysK: mechanism of binding, interaction specificity and competition with cysteine synthase.
Scientific Reports. Roč. 7, Aug 18 (2017), č. článku 8817. ISSN 2045-2322
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: O-acetylserine sulfhydrylase * dependent growth inhibition * Salmonella typhimurium LT-2
Kód oboru RIV: CE - Biochemie
Impakt faktor: 4.259, rok: 2016
https://www.nature.com/articles/s41598-017-09022-6
Hayes, C. S.
- Campanini, B.
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0274571

0475585 - UOCHB-X 2018 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Benoni, Roberto - De Bei, O. - Paredi, G. - Hayes, C. S. - Franko, N. - Mozzarelli, A. - Bettati, S. - Campanini, B.
Modulation of Escherichia coli serine acetyltransferase catalytic activity in the cysteine synthase complex.
FEBS Letters. Roč. 591, č. 9 (2017), s. 1212-1224 ISSN 0014-5793
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: cysteine synthase * protein-protein interaction * serine acetyltransferase
Kód oboru RIV: CE - Biochemie
Impakt faktor: 3.623, rok: 2016
Campanini, B.
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0272683

0475989 - UOCHB-X 2018 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Bertolotti, B. - Sutkeviciute, I. - Ambrosini, M. - Ribeiro-Viana, R. - Rojo, J. - Fieschi, F. - Dvořáková, H. - Kašáková, M. - Parkan, K. - Hlaváčková, M. - Nováková, Kateřina - Moravcová, J.
Polyvalent C-glycomimetics based on L-fucose or D-mannose as potent DC-SIGN antagonists.
Organic & Biomolecular Chemistry. Roč. 15, č. 18 (2017), s. 3995-4004 ISSN 1477-0520
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: glycomimetics * DC_SIGN * antagonist
Kód oboru RIV: CC - Organická chemie
Impakt faktor: 3.564, rok: 2016
Moravcová, J.
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0272561

0479628 - UOCHB-X 2018 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Bettanin, F. - Ferrao, L. F. A. - Pinheiro Jr., M. - Aquino, A. J. A. - Lischka, H. - Machado, F. B. C. - Nachtigallová, Dana
Singlet L-a and L-b Bands for N-Acenes (N = 2-7): A CASSCF/CASPT2 Study.
Journal of Chemical Theory and Computation. Roč. 13, č. 9 (2017), s. 4297-4306 ISSN 1549-9618
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA16-16959S
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: polycyclic aromatic hydrocarbons * density functional theory * theory/multireference configuration interaction
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 5.245, rok: 2016
Ferrao, L. F. A.
- Machado, F. B. C.
- Nachtigallová, Dana
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0275606

0474980 - UOCHB-X 2018 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Bignon, E. - Dršata, Tomáš - Morell, C. - Lankaš, Filip - Dumont, E.
Interstrand cross-linking implies contrasting structural consequences for DNA: insights from molecular dynamics.
Nucleic Acids Research. Roč. 45, č. 4 (2017), s. 2188-2195 ISSN 0305-1048
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA14-21893S
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: abasic sites * duplex DNA * mechanical properties
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Impakt faktor: 10.162, rok: 2016
https://academic.oup.com/nar/article-lookup/doi/10.1093/nar/gkw1253
Lankaš, Filip
- Dumont, E.
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0271867

0474554 - UEB-Q 2018 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Bildziukevich, Uladzimir - Kaletová, Eva - Šaman, David - Sievanen, E. - Kolehmainen, E. T. - Šlouf, Miroslav - Wimmer, Zdeněk
Spectral and microscopic study of self-assembly of novel cationic spermine amides of betulinic acid.
Steroids. Roč. 117 (2017), s. 90-96 ISSN 0039-128X
Grant CEP: GA MŠk(CZ) LD13057; GA MŠk LD15012; GA MŠk(CZ) LO1507
Institucionální podpora: RVO:61389030 ; RVO:61388963 ; RVO:61389013
Klíčová slova: derivatives * squalamine * gelation * cancer * agents * cells * Spermine * Betulinic acid * afm * sem * tem * dosy-NMR
Kód oboru RIV: CC - Organická chemie
Impakt faktor: 2.282, rok: 2016
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0271580

0475174 - UOCHB-X 2018 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Bilkova, E. - Pleskot, Roman - Rissanen, S. - Sun, S. - Czogalla, A. - Cwiklik, Lukasz - Róg, T. - Vattulainen, I. - Cremer, P. S. - Jungwirth, Pavel - Coskun, U.
Calcium Directly Regulates Phosphatidylinositol 4,5-Bisphosphate Headgroup Conformation and Recognition.
Journal of the American Chemical Society. Roč. 139, č. 11 (2017), s. 4019-4024 ISSN 0002-7863
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA16-01074S
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: membrane * calcium ions * PIP2 * molecular dynamics
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 13.858, rok: 2016
http://pubs.acs.org/doi/full/10.1021/jacs.6b11760
Cremer, P. S.
- Jungwirth, Pavel
- Coskun, U.
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0272021

0482651 - UOCHB-X 2018 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Blahut, J. - Bernášek, K. - Gálisová, A. - Herynek, V. - Císařová, I. - Kotek, J. - Lang, J. - Matějková, Stanislava - Hermann, P.
Paramagnetic F-19 Relaxation Enhancement in Nickel(II) Complexes of N-Trifluoroethyl Cyclam Derivatives and Cell Labeling for F-19 MRI.
Inorganic Chemistry. Roč. 56, č. 21 (2017), s. 13337-13348 ISSN 0020-1669
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: magnetic resonance * clinical applications * macrocyclic ligands
Kód oboru RIV: CA - Anorganická chemie
Impakt faktor: 4.857, rok: 2016
Hermann, P.
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0278076

0474969 - UOCHB-X 2018 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Blastik, Zsófia E. - Voltrová, Svatava - Matoušek, V. - Jurásek, Bronislav - Manley, David W. - Klepetářová, Blanka - Beier, Petr
Azidoperfluoroalkanes: Synthesis and Application in Copper(I)-Catalyzed Azide-Alkyne Cycloaddition.
Angewandte Chemie - International Edition. Roč. 56, č. 1 (2017), s. 346-349 ISSN 1433-7851
GRANT EU: European Commission(XE) 607787 - FLUOR21
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: azides * click reactions * fluorine * perfluoroalkanes * triazoles
Kód oboru RIV: CC - Organická chemie
Impakt faktor: 11.994, rok: 2016
Beier, Petr
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0271859

0475314 - UOCHB-X 2018 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Bodláková, K. - Jedlička, Pavel - Kodrík, Dalibor
Adipokinetic hormones control amylase activity in the cockroach (Periplaneta americana) gut.
Insect Science. Roč. 24, č. 2 (2017), s. 259-269 ISSN 1672-9609
Grant CEP: GA ČR GA14-07172S
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:60077344
Klíčová slova: AKH * AKH receptor * amylase * enzyme * gene expression * midgut
Kód oboru RIV: ED - Fyziologie
Impakt faktor: 2.026, rok: 2016
Kodrík, Dalibor
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0272148

0474869 - MBU-M 2018 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Bojarová, Pavla - Chytil, Petr - Mikulová, Barbora - Bumba, Ladislav - Konefal, Rafal - Pelantová, Helena - Krejzová, Jana - Slámová, Kristýna - Petrásková, Lucie - Kotrchová, Lenka - Cvačka, Josef - Etrych, Tomáš - Křen, Vladimír
Glycan-decorated HPMA copolymers as high-affinity lectin ligands.
Polymer Chemistry. Roč. 8, č. 17 (2017), s. 2647-2658 ISSN 1759-9954
Grant CEP: GA ČR GC15-02578J; GA MZd(CZ) NV16-28594A; GA MŠk(CZ) LD15085; GA MŠk(CZ) LM2015064; GA MŠk(CZ) LO1507
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:61389013 ; RVO:61388963
Klíčová slova: BETA-N-ACETYLHEXOSAMINIDASE * WHEAT-GERM-AGGLUTININ * CLICK CHEMISTRY
Kód oboru RIV: CE - Biochemie
Impakt faktor: 5.375, rok: 2016
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0271798

0476166 - UOCHB-X 2018 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Bondar, A. - Lazar, Josef
The G protein G(i1) exhibits basal coupling but not preassembly with G protein-coupled receptors.
Journal of Biological Chemistry. Roč. 292, č. 23 (2017), s. 9690-9698 ISSN 0021-9258
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: resonance energy transfer * CB1 cannabinoid receptor * living cells
Kód oboru RIV: CE - Biochemie
Impakt faktor: 4.125, rok: 2016
Bondar, A.
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0272696

0477107 - UOCHB-X 2018 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Bouřa, Evžen - Bäumlová, Adriana - Chalupská, Dominika - Dubánková, Anna - Klíma, Martin
Metal ions-binding T4 lysozyme as an intramolecular protein purification tag compatible with X-ray crystallography.
Protein Science. Roč. 26, č. 6 (2017), s. 1116-1123 ISSN 0961-8368
Grant CEP: GA ČR(CZ) GJ17-07058Y; GA MŠk LO1302
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: phage T4 * lysozyme * endolysin * histidine tag * protein purification * crystal structure
Kód oboru RIV: CE - Biochemie
Impakt faktor: 2.523, rok: 2016
Klíma, Martin
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0273493

0477872 - UOCHB-X 2018 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Brandt, J. R. - Pospíšil, Lubomír - Bednárová, Lucie - da Costa, R. C. - White, A. J. P. - Mori, T. - Teplý, Filip - Fuchter, M. J.
Intense redox-driven chiroptical switching with a 580 mV hysteresis actuated through reversible dimerization of an azoniahelicene.
Chemical Communications. Roč. 53, č. 65 (2017), s. 9059-9062 ISSN 1359-7345
Grant CEP: GA MZd(CZ) NV16-31156A
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: electron transfer * electrochiroptical response * molecular switches
Kód oboru RIV: CC - Organická chemie
Impakt faktor: 6.319, rok: 2016
http://pubs.rsc.org/en/content/articlepdf/2017/cc/c7cc04903j
Fuchter, M. J.
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0274087

0475565 - UOCHB-X 2018 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Briant, K. - Johnson, Nicholas - Swanton, E.
Transmembrane domain quality control systems operate at the endoplasmic reticulum and Golgi apparatus.
PLoS ONE. Roč. 12, č. 4 (2017), č. článku e0173924. E-ISSN 1932-6203
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: integral membrane proteins * human CD8 glycoprotein * ubiquitin ligase
Kód oboru RIV: CE - Biochemie
Impakt faktor: 2.806, rok: 2016
http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0173924
Swanton, E.
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0272252

0474959 - UOCHB-X 2018 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Buckley, L. E. R. - Coe, B. J. - Rusanova, D. - Sánchez, S. - Jirásek, Michael - Joshi, Vishwas - Vávra, Jan - Khobragade, Dushant - Pospíšil, Lubomír - Ramešová, Šárka - Císařová, I. - Šaman, David - Pohl, Radek - Clays, K. - Van Steerteghem, N. - Brunschwig, B. S. - Teplý, Filip
Ferrocenyl helquats: unusual chiral organometallic nonlinear optical chromophores.
Dalton Transactions. Roč. 46, č. 4 (2017), s. 1052-1064 ISSN 1477-9226
Grant CEP: GA ČR GA13-19213S; GA ČR(CZ) GA16-03085S
AV ČR(CZ) M200551208
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:61388955
Klíčová slova: hyper-Rayleigh scattering * structure-property relationship * transition metal complexes
Kód oboru RIV: CC - Organická chemie
Impakt faktor: 4.029, rok: 2016
Coe, B. J.
- Teplý, Filip
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0271852

0478612 - UOCHB-X 2018 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Buckley, L. E. R. - Coe, B. J. - Rusanova, D. - Joshi, Vishwas - Sánchez, S. - Jirásek, Michael - Vávra, Jan - Khobragade, Dushant - Severa, Lukáš - Císařová, I. - Šaman, David - Pohl, Radek - Clays, K. - Depotter, G. - Brunschwig, B. S. - Teplý, Filip
Tunable Chiral Second-Order Nonlinear Optical Chromophores Based on Helquat Dications.
Journal of Physical Chemistry A. Roč. 121, č. 31 (2017), s. 5842-5855 ISSN 1089-5639
Grant CEP: GA ČR GA13-19213S; GA MZd(CZ) NV16-31156A
AV ČR(CZ) M200551208
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: hyper-Rayleigh scattering * excited states * derivatives
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 2.847, rok: 2016
Coe, B. J.
- Teplý, Filip
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0274677

0474370 - MBU-M 2018 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Bugáňová, Martina - Pelantová, Helena - Holubová, Martina - Šedivá, B. - Maletínská, Lenka - Železná, Blanka - Kuneš, Jaroslav - Kačer, Petr - Kuzma, Marek - Haluzík, M.
The effects of liraglutide in mice with diet-induced obesity studied by metabolomics.
Journal of Endocrinology. Roč. 233, č. 1 (2017), s. 93-104 ISSN 0022-0795
Grant CEP: GA ČR GA13-14105S; GA MŠk(CZ) LO1509
Ministerstvo pro místní rozvoj(CZ) CZ.2.16/3.1.00/24023
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:61388963
Klíčová slova: NMR metabolomics * obesity * type 2 diabetes mellitus
Kód oboru RIV: EE - Mikrobiologie, virologie
Impakt faktor: 4.706, rok: 2016
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0271458

0482603 - UOCHB-X 2018 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Buchanan, E. A. - Michl, Josef
Packing Guidelines for Optimizing Singlet Fission Matrix Elements in Noncovalent Dimers.
Journal of the American Chemical Society. Roč. 139, č. 44 (2017), s. 15572-15575 ISSN 0002-7863
Grant CEP: GA ČR GA15-19143S
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: exciton fission * solar cells * thin film
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 13.858, rok: 2016
Michl, Josef
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0278018

0474789 - UOCHB-X 2018 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Bürglová, K. - Okorochenkov, S. - Buděšínský, Miloš - Hlaváč, J.
Efficient Method for Aromatic-Aldehyde Oxidation by Cleavage of Their Hydrazones Catalysed by Trimethylsilanolate.
European Journal of Organic Chemistry. Roč. 2017, č. 2 (2017), s. 389-396 ISSN 1434-193X
Grant CEP: GA MŠk(CZ) LO1304
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: aldehydes * oxidation * hydrazones * solid-phase synthesis * reaction mechanisms
Kód oboru RIV: CC - Organická chemie
Impakt faktor: 2.834, rok: 2016
Hlaváč, J.
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0271742

0481091 - UOCHB-X 2018 RIV CZ cze J - Článek v odborném periodiku
Cahová, Hana
I prokaryota si chrání svoji RNA – nové typy 5'-RNA čepiček.
[Prokaryotes also Protect their RNAs – New Types of 5' RNA Caps.]
Chemické listy. Roč. 111, č. 7 (2017), s. 414-423 ISSN 0009-2770
Grant CEP: GA ČR(CZ) GJ16-16358Y
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: 5'-RNA cap * NAD-RNA * RNA chemical modification
Kód oboru RIV: CE - Biochemie
Impakt faktor: 0.387, rok: 2016
http://www.chemicke-listy.cz/docs/full/2017_07_414-423.pdf
Cahová, Hana
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0276705

0479733 - UOCHB-X 2018 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Capasso, C. - Magarkar, Aniket - Cervera-Carrascon, V. - Fusciello, M. - Feola, S. - Muller, M. - Garofalo, M. - Kuryk, L. - Tähtinen, S. - Pastore, L. - Bunker, A. - Cerullo, V.
A novel in silico framework to improve MHC-I epitopes and break the tolerance to melanoma.
ONCOIMMUNOLOGY. Roč. 6, č. 9 (2017), č. článku e1319028. ISSN 2162-402X
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: cancer vaccine * heteroclitic peptides * immunotherapy * in silico * prediction servers * tumor antigens
Kód oboru RIV: EC - Imunologie
Impakt faktor: 7.719, rok: 2016
Cerullo, V.
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0275684

0474191 - UOCHB-X 2018 RIV IE eng J - Článek v odborném periodiku
Carazo, A. - Hyršová, L. - Dušek, J. - Chodounská, Hana - Horvátová, A. - Berka, K. - Bazgier, V. - Gan-Schreier, H. - Chamulitrat, W. - Kudová, Eva - Pávek, P.
Acetylated deoxycholic (DCA) and cholic (CA) acids are potent ligands of pregnane X (PXR) receptor.
Toxicology Letters. Roč. 265, Jan 4 (2017), s. 86-96 ISSN 0378-4274
Grant CEP: GA TA ČR(CZ) TE01020028
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: PXR * metabolism * bile acids * nuclear receptors * FXR
Kód oboru RIV: CC - Organická chemie
Impakt faktor: 3.858, rok: 2016
Pávek, P.
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0271341

0478322 - UOCHB-X 2018 CZ cze K - Konferenční příspěvek (tuzemská konf.)
Cvačka, Josef
Derivatizace v hmotnostní spektrometrii pro určování struktury.
[Derivatization in mass spectrometry for structure elucidation.]
Sborník 18. ročníku Školy hmotnostní spektrometrie. Praha: Spektroskopická společnost Jana Marka Marci, 2017 - (Polášek, M.; Španěl, P.). ISBN 978-80-88195-04-7.
[Škola hmotnostní spektrometrie /18./. Luhačovice (CZ), 11.09.2017-15.09.2017]
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: mass spectrometry * derivatization
Kód oboru RIV: CB - Analytická chemie, separace
Cvačka, Josef
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0274450

0478325 - UOCHB-X 2018 CZ cze K - Konferenční příspěvek (tuzemská konf.)
Cvačka, Josef
Úvod do problematiky interpretace EI spekter.
[Introduction to Interpretation of EI Spectra.]
Sborník Kurzu interpretace EI spekter. Praha: Spektroskopická společnost Jana Marka Marci, 2017 - (Polášek, M.). ISBN 978-80-88195-05-4.
[Kurz interpretace EI spekter. Luhačovice (CZ), 10.09.2017-11.09.2017]
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: mass spectrometry * interpretation
Kód oboru RIV: CB - Analytická chemie, separace
Cvačka, Josef
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0274466

0481749 - UOCHB-X 2018 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Danne, R. - Poojari, C. - Martinez-Seara, Hector - Rissanen, S. - Lolicato, F. - Róg, T. - Vattulainen, I.
doGlycans-Tools for Preparing Carbohydrate Structures for Atomistic Simulations of Glycoproteins, Glycolipids, and Carbohydrate Polymers for GROMACS.
Journal of Chemical Information and Modeling. Roč. 57, č. 10 (2017), s. 2401-2406 ISSN 1549-9596
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: molecular dynamics simulations * GROMOS force field * cellulose nanofibrils
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 3.760, rok: 2016
http://pubs.acs.org/doi/full/10.1021/acs.jcim.7b00237
Róg, T.
- Vattulainen, I.
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0277434

0474787 - UOCHB-X 2018 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Di Giglio, M. G. - Muttenthaler, M. - Harpsoe, K. - Liutkeviciute, Z. - Keov, P. - Eder, T. - Rattei, T. - Arrowsmith, S. - Wray, S. - Marek, Aleš - Elbert, Tomáš - Alewood, P. F. - Gloriam, D. E. - Gruber, C. W.
Development of a human vasopressin V-1a-receptor antagonist from an evolutionary-related insect neuropeptide.
Scientific Reports. Roč. 7, Feb 1 (2017), č. článku 41002. ISSN 2045-2322
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: neuropeptide * inotocin * V1aR-antagonist
Kód oboru RIV: CE - Biochemie
Impakt faktor: 4.259, rok: 2016
https://www.nature.com/articles/srep41002
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0271736

0477082 - UOCHB-X 2018 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Doležal, P. - Kyjaková, Pavlína - Valterová, Irena - Urban, Š.
Qualitative analyses of less-volatile organic molecules from female skin scents by comprehensive two dimensional gas chromatography-time of flight mass spectrometry.
Journal of Chromatography A. Roč. 1505, Jul 7 (2017), s. 77-86 ISSN 0021-9673.
[International Symposium on Capillary Chromatography /40./ and GCxGC Symposium /13./. Riva del Garda, 29.05.2016-03.06.2016]
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: human scent analysis * molecular composition of human scent * forensic chemistry * human scent signature * GCxGC-TOFMS
Kód oboru RIV: CB - Analytická chemie, separace
Impakt faktor: 3.981, rok: 2016
Doležal, P.
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0273482

0477455 - UOCHB-X 2018 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Downey, Alan Michael - Hocek, Michal
Strategies toward protecting group-free glycosylation through selective activation of the anomeric center.
Beilstein Journal of Organic Chemistry. Roč. 13, Jun 27 (2017), s. 1239-1279 ISSN 1860-5397
Grant CEP: GA TA ČR(CZ) TE01020028
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: glycosides * glycosylation * oligosaccharides * protecting groups
Kód oboru RIV: CC - Organická chemie
Impakt faktor: 2.337, rok: 2016
http://www.beilstein-journals.org/bjoc/articles/13/123
Hocek, Michal
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0273804

0475194 - UOCHB-X 2018 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Downey, Alan Michael - Pohl, Radek - Roithová, J. - Hocek, Michal
Synthesis of Nucleosides through Direct Glycosylation of Nucleobases with 5-O-Monoprotected or 5-Modified Ribose: Improved Protocol, Scope, and Mechanism.
Chemistry - A European Journal. Roč. 23, č. 16 (2017), s. 3910-3917 ISSN 0947-6539
Grant CEP: GA TA ČR(CZ) TE01020028; GA ČR(CZ) GA16-00178S
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: epoxides * glycosylation * nucleosides * riboses * synthesis design
Kód oboru RIV: CC - Organická chemie
Impakt faktor: 5.317, rok: 2016
Hocek, Michal
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0272048

0474961 - UOCHB-X 2018 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Dračínský, Martin - Storch, Jan - Církva, Vladimír - Císařová, I. - Sýkora, Jan
Internal dynamics in helical molecules studied by X-ray diffraction, NMR spectroscopy and DFT calculations.
Physical Chemistry Chemical Physics. Roč. 19, č. 4 (2017), s. 2900-2907 ISSN 1463-9076
Grant CEP: GA ČR GA15-11223S; GA ČR GA15-12719S
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:67985858
Klíčová slova: helicene * NMR spectroscopy * DFT calculations
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 4.123, rok: 2016
http://pubs.rsc.org/en/content/articlehtml/2013/cp/c6cp07552e

Dračínský, Martin Sýkora, Jan
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0271854

0477427 - UOCHB-X 2018 RIV GB eng M - Část monografie knihy
Dračínský, Martin
The Chemical Bond: The Perspective of NMR Spectroscopy.
Annual Reports on NMR Spectroscopy. Vol. 90. Oxford: Academic Press, 2017 - (Webb, G.), s. 1-40. ISBN 978-0-12-812009-5
Grant CEP: GA ČR GA15-11223S
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: NMR spectroscopy * chemical bonding * DFT calculations * hydrogen bonding
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Dračínský, Martin
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0273781

0480308 - FZU-D 2018 RIV CH eng C - Konferenční příspěvek (zahraniční konf.)
Drbohlavová, Lucie - Gerbedoen, J.C. - Taylor, Andrew - Talbi, A. - Fekete, Ladislav - Ashcheulov, Petr - Soltani, A. - Bovtun, Viktor - Kempa, Martin - Bartoň, Jan - Cígler, Petr - Mortet, Vincent
Diamond coated LW-SAW sensors-study of diamond thickness effect.
Proceedings (Basel, Switzerland). Vol. 1. Basel: MDPI, 2017, s. 1-4, č. článku 540. E-ISSN 2504-3900.
[Eurosensors 2017. Paris (FR), 03.09.2017-06.09.2017]
Grant CEP: GA MPO FV10312
AV ČR(CZ) Fellowship J. E. Purkyně
Institucionální podpora: RVO:68378271 ; RVO:61388963
Klíčová slova: love waves * acoustic sensors * CVD diamond * sensing in liquids
Kód oboru RIV: BM - Fyzika pevných látek a magnetismus
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0276124

0478190 - UOCHB-X 2018 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Dresler, J. - Krůtová, M. - Fučíková, A. - Klimentová, J. - Hrůzová, V. - Ďuráčová, M. - Houdková, K. - Salovská, B. - Matějková, J. - Hubálek, Martin - Pajer, P. - Píša, L. - Nyč, O.
Analysis of proteomes released from in vitro cultured eight Clostridium difficile PCR ribotypes revealed specific expression in PCR ribotypes 027 and 176 confirming their genetic relatedness and clinical importance at the proteomic level.
Gut Pathogens. Roč. 9, Aug 14 (2017), č. článku 45. ISSN 1757-4749
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: Clostridium difficile * label-free quantification * proteome * PCR ribotype 027 * PCR ribotype 176
Kód oboru RIV: EE - Mikrobiologie, virologie
Impakt faktor: 2.756, rok: 2016
https://gutpathogens.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13099-017-0194-9
Dresler, J.
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0274367

0477547 - UOCHB-X 2018 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Dršata, Tomáš - Réblová, K. - Beššeová, I. - Šponer, J. - Lankaš, Filip
rRNA C-Loops: Mechanical Properties of a Recurrent Structural Motif.
Journal of Chemical Theory and Computation. Roč. 13, č. 7 (2017), s. 3359-3371 ISSN 1549-9618
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA14-21893S
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: molecular dynamics simulations * residual dipolar couplings * A-site finger
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Impakt faktor: 5.245, rok: 2016
Lankaš, Filip
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0273868