Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.

Publikace ASEP

Označit vše / Zobrazit vše / Zrušit označení

Nalezeno záznamů: 41

0476643 - BFU-R 2018 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Bagherpoor, Alireza Jian - Doležalová, Dáša - Bárta, T. - Kučírek, Martin - Sani, Soodabeh Abbasi - Esner, M. - Bosakova, M.K. - Vinařský, V. - Peškova, L. - Hampl, A. - Štros, Michal
Properties of Human Embryonic Stem Cells and Their Differentiated Derivatives Depend on Nonhistone DNA-Binding HMGB1 and HMGB2 Proteins.
Stem Cells and Development. Roč. 26, č. 5 (2017), s. 328-340 ISSN 1547-3287
Grant CEP: GA ČR GA15-01354S; GA ČR(CZ) GA15-23033S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: group box 1 * chromatin protein * expression
Kód oboru RIV: EB - Genetika a molekulární biologie
Impakt faktor: 3.562, rok: 2016
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0273108

0476428 - BFU-R 2018 RIV AT eng J - Článek v odborném periodiku
Bártová, Eva - Malyšková, Barbora - Komůrková, Denisa - Legartová, Soňa - Suchánková, Jana - Krejčí, Jana - Kozubek, Stanislav
Function of heterochromatin protein 1 during DNA repair.
Protoplasma. Roč. 254, č. 3 (2017), s. 1233-1240 ISSN 0033-183X
Grant CEP: GA ČR GBP302/12/G157; GA MŠk 7F14369
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: double-strand breaks * damage response * HP1 protein
Kód oboru RIV: EB - Genetika a molekulární biologie
Impakt faktor: 2.870, rok: 2016
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0272939

0471362 - BFU-R 2017 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Černocká, Hana - Paleček, Emil
Voltammetric and chronopotentiometric protein structure-sensitive analysis.
Electrochimica acta. Roč. 224, JAN2017 (2017), s. 211-219 ISSN 0013-4686
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA15-15479S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: circular-dichroism spectroscopy * catalytic hydrogen evolution * mercury-electrodes
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Impakt faktor: 4.798, rok: 2016
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0269286

0476556 - BFU-R 2018 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Dudová, Zdenka - Bartošík, M. - Fojta, Miroslav
Magnetic bead-based electrochemical assay for determination of DNA methyltransferase activity.
Electrochimica acta. Roč. 231 (2017), s. 575-581 ISSN 0013-4686
Grant CEP: GA ČR GBP206/12/G151; GA ČR(CZ) 17-08971S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: promoter hypermethylation * gene-expression * cell-lines
Kód oboru RIV: CG - Elektrochemie
Impakt faktor: 4.798, rok: 2016
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0273032

0476541 - BFU-R 2018 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Figiel, M. - Krepl, Miroslav - Poznanski, J. - Gotab, A. - Šponer, Jiří - Nowotny, M.
Coordination between the polymerase and RNase H activity of HIV-1 reverse transcriptase.
Nucleic Acids Research. Roč. 45, č. 6 (2017), s. 3341-3352 ISSN 0305-1048
Grant CEP: GA ČR GAP208/12/1878
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: human-immunodeficiency-virus * rna/dna hybrid * force-field
Kód oboru RIV: CE - Biochemie
Impakt faktor: 10.162, rok: 2016
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0273021

0476559 - BFU-R 2018 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Gajarský, M. - Zivkovic, M.L. - Stadlbauer, Petr - Pagano, B. - Fiala, R. - Amato, J. - Tomáška, L´. - Šponer, Jiří - Plavec, J. - Trantírek, L.
Structure of a Stable G-Hairpin.
Journal of the American Chemical Society. Roč. 139, č. 10 (2017), s. 3591-3594 ISSN 0002-7863
Grant CEP: GA ČR GA13-28310S; GA ČR(CZ) GA16-13721S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: g-quadruplex structures * human telomeric dna * single-stranded-dna * g-triplex
Kód oboru RIV: CE - Biochemie
Impakt faktor: 13.858, rok: 2016
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0273034

0476649 - BFU-R 2018 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Garcia, S. - Kovařík, Aleš - Leitch, A. R. - Garnatje, T.
Cytogenetic features of rRNA genes across land plants: analysis of the Plant rDNA database.
Plant Journal. Roč. 89, č. 5 (2017), s. 1020-1030 ISSN 0960-7412
Grant CEP: GA ČR(CZ) GC16-02149J
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: in-situ hybridization * 5s rdna * 45s rdna * concerted evolution
Kód oboru RIV: EF - Botanika
Impakt faktor: 5.901, rok: 2016
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0273113

0476444 - BFU-R 2018 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Gresh, N. - Naseem-Khan, S. - Lagardere, L. - Piquemal, J.P. - Šponer, Judit E. - Šponer, Jiří
Channeling through Two Stacked Guanine Quartets of One and Two Alkali Cations in the Li+, Na+, K+, and Rb+ Series. Assessment of the Accuracy of the SIBFA Anisotropic Polarizable Molecular Mechanics Potential.
Journal of Physical Chemistry B. Roč. 121, č. 16 (2017), s. 3997-4014 ISSN 1520-6106
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA16-13721S; GA MŠk(CZ) LQ1601
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: intermolecular interaction energies * quantum-chemical computations * classical drude oscillator * kit promoter quadruplex
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Impakt faktor: 3.177, rok: 2016
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0272945

0478385 - UACH-T 2018 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Holub, Josef - El Anwar, Suzan - Jelínek, T. - Fojt, Lukáš - Růžičková, Z. - Šolínová, Veronika - Kašička, Václav - Gabel, D. - Grüner, Bohumír
Polyhalogenated Decaborate and 1-Ammoniododecaborate Ions: An Improved Synthesis with Elemental Halogens, and Physicochemical and Chemical Properties.
European Journal of Inorganic Chemistry. Roč. 2017, 38-39 (2017), s. 4499-4509 ISSN 1434-1948
Grant CEP: GA TA ČR(CZ) TH01020844
Institucionální podpora: RVO:61388980 ; RVO:68081707 ; RVO:61388963
Klíčová slova: Boranes * Borates * Capillary electrophoresis * Electrochemistry * Halogenation
Kód oboru RIV: CA - Anorganická chemie
Impakt faktor: 2.444, rok: 2016
Grüner, Bohumír
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0277729

0476269 - BFU-R 2018 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Hrabina, O. - Kašpárková, J. - Suchánková, Tereza - Novohradský, Vojtěch - Guo, Z. - Brabec, Viktor
Unique structural properties of DNA interstrand cross-links formed by a new antitumor dinuclear Pt(II) complex.
Metallomics. Roč. 9, č. 5 (2017), s. 494-500 ISSN 1756-5901
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: cisplatin-modified dna * nucleotide excision-repair * hmg domain proteins
Kód oboru RIV: CE - Biochemie
Impakt faktor: 3.975, rok: 2016
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0272811

0476739 - BFU-R 2018 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Intini, F. P. - Zajac, Juraj - Novohradský, Vojtěch - Saltarella, T. - Pacifico, C. - Brabec, Viktor - Natile, G. - Kašpárková, Jana
Novel Antitumor Platinum(II) Conjugates Containing the Nonsteroidal Anti-inflammatory Agent Diclofenac: Synthesis and Dual Mechanisms of Antiproliferative Effects.
Inorganic Chemistry. Roč. 56, č. 3 (2017), s. 1483-1497 ISSN 0020-1669
Grant CEP: GA ČR(CZ) GP17-05302S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: anticancer drug carboplatin * colon-cancer cells * in-vitro
Kód oboru RIV: CA - Anorganická chemie
Impakt faktor: 4.857, rok: 2016
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0273164

0476673 - BFU-R 2018 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Jurečková, J. - Sýkorová, Eva - Hafidh, Said - Honys, David - Fajkus, Jiří - Fojtová, M.
Tissue-specific expression of telomerase reverse transcriptase gene variants in Nicotiana tabacum.
Planta. Roč. 245, č. 3 (2017), s. 549-561 ISSN 0032-0935
Grant CEP: GA ČR GA13-06943S; GA MŠk(CZ) LQ1601
Institucionální podpora: RVO:68081707 ; RVO:61389030
Klíčová slova: male gametophyte development * tobacco male gametophyte * allotetraploid nicotiana
Kód oboru RIV: EF - Botanika; EF - Botanika (UEB-Q)
Impakt faktor: 3.361, rok: 2016
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0273131

0476126 - BFU-R 2018 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Kasalová, A. - Hrstka, R. - Hernychová, L. - Coufalová, D. - Ostatná, Veronika
Chronopotentiometric sensing of anterior gradient 2 protein.
Electrochimica acta. Roč. 240 (2017), s. 250-257 ISSN 0013-4686
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA13-00956S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: catalyzed hydrogen evolution * mercury-electrodes * affinity tags
Kód oboru RIV: CG - Elektrochemie
Impakt faktor: 4.798, rok: 2016
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0272678

0476265 - BFU-R 2018 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Kejnovská, Iva - Bednářová, Klára - Renčiuk, Daniel - Dvořáková, Zuzana - Školáková, Petra - Trantírek, L. - Fiala, R. - Vorlíčková, Michaela - Sagi, J.
Clustered abasic lesions profoundly change the structure and stability of human telomeric G-quadruplexes.
Nucleic Acids Research. Roč. 45, č. 8 (2017), s. 4294-4305 ISSN 0305-1048
Grant CEP: GA MŠk EF15_003/0000477; GA ČR GAP205/12/0466; GA ČR GA13-28310S; GA ČR(CZ) GA15-06785S; GA MŠk(CZ) LQ1601
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: dna-damage clusters * k+ solution * guanine quadruplexes
Kód oboru RIV: CE - Biochemie
Impakt faktor: 10.162, rok: 2016
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0272809

0476246 - BFU-R 2018 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Klimeš, P. - Turek, D. - Mazura, P. - Gallová, L. - Spíchal, L. - Brzobohatý, Břetislav
High Throughput Screening Method for Identifying Potential Agonists and Antagonists of Arabidopsis thaliana Cytokinin Receptor CRE1/AHK4.
Frontiers in Plant Science. Roč. 8, JUN 2017 (2017), č. článku 947. ISSN 1664-462X
Klíčová slova: signaling pathway * histidine kinases * plant-growth
Kód oboru RIV: EF - Botanika
Impakt faktor: 4.298, rok: 2016
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0272794

0473751 - FZU-D 2018 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Kratochvílová, Irena - Golan, Martin - Pomeisl, Karel - Richter, Jan - Sedláková, Silvia - Šebera, Jakub - Mičová, Júlia - Falk, Martin - Falková, Iva - Řeha, David - Elliott, J.R. - Varga, K. - Follett, S.E. - Šimek, Daniel
Theoretical and experimental study of the antifreeze protein AFP752, trehalose and dimethyl sulfoxide cryoprotection mechanism: correlation with cryopreserved cell viability.
RSC Advances. Roč. 7, č. 1 (2017), s. 352-360 ISSN 2046-2069
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA15-05095S; GA MŠk LO1409; GA ČR(CZ) GA14-10279S; GA ČR(CZ) GA16-12454S; GA ČR GBP302/12/G157; GA MZd NV16-29835A
FUNBIO(XE) CZ.2.16/3.1.00/21568
Institucionální podpora: RVO:68378271 ; RVO:61388971 ; RVO:68081707
Klíčová slova: X-ray diffraction * DFT * Raman spectroscopy * DSC * cryoprotectants
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika; EE - Mikrobiologie, virologie (MBU-M)
Impakt faktor: 3.108, rok: 2016
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0270892

0481822 - BFU-R 2018 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Mahelka, Vaclav - Krak, Karol - Kopecky, David - Fehrer, Judith - Safar, Jan - Bartos, Jan - Hobza, Roman - Blavet, Nicolas - Blattner, Frank R.
Multiple horizontal transfers of nuclear ribosomal genes between phylogenetically distinct grass lineages.
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Roč. 114, č. 7 (2017), s. 1726-1731 ISSN 0027-8424
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: parasitic plant * hordeum poaceae * transposable elements
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Impakt faktor: 9.661, rok: 2016
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0277292

0476449 - BFU-R 2018 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Maier, L. - Khirsariya, P. - Hylse, O. - Adla, S.K. - Cernova, L. - Poljak, M. - Krajčovičová, S. - Weis, E. - Drápela, Stanislav - Souček, Karel - Paruch, K.
Diastereoselective Flexible Synthesis of Carbocyclic C-Nucleosides.
Journal of Organic Chemistry. Roč. 82, č. 7 (2017), s. 3382-3402 ISSN 0022-3263
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: mitsunobu * catalysis * alcohols
Kód oboru RIV: CC - Organická chemie
Impakt faktor: 4.849, rok: 2016
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0272947

0473616 - BFU-R 2018 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Manzano, S. - Megias, Z. - Martinez, C. - Garcia, A. - Aguado, E. - Chileh, T. - Lopez-Alonso, D. - Garcia-Maroto, F. - Kejnovský, Eduard - Široký, Jiří - Kubát, Zdeněk - Králová, Tereza - Vyskot, Boris - Jamilena, M.
Overexpression of a flower-specific aerolysin-like protein from the dioecious plant Rumex acetosa alters flower development and induces male sterility in transgenic tobacco.
Plant Journal. Roč. 89, č. 1 (2017), s. 58-72 ISSN 0960-7412
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: sex determination * Rumex acetosa * aerolysin-like protein
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Impakt faktor: 5.901, rok: 2016
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0270753

0476264 - BFU-R 2018 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Novohradský, Vojtěch - Zamora, A. - Gandioso, A. - Brabec, Viktor - Ruiz, J. - Marchan, V.
Somatostatin receptor-targeted organometallic iridium(III) complexes as novel theranostic agents.
Chemical Communications. Roč. 53, č. 40 (2017), s. 5523-5526 ISSN 1359-7345
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: anticancer activity * peptide-hormones * cancer-therapy
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Impakt faktor: 6.319, rok: 2016
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0272808

0476545 - BFU-R 2018 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Ostatná, Veronika - Vargová, Veronika - Kekedy-Nagy, L. - Černocká, Hana - Ferapontova, E.E.
Chronopotentiometric sensing of specific interactions between lysozyme and the DNA aptamer.
Bioelectrochemistry. Roč. 114, APR2017 (2017), s. 42-47 ISSN 1567-5394
Grant CEP: GA ČR GA13-00956S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: self-assembled monolayers * protein interactions * lysozyme
Kód oboru RIV: CE - Biochemie
Impakt faktor: 3.346, rok: 2016
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0273024

0471937 - BFU-R 2017 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Plesingerova, E. - Librová, H. - Plevová, K. - Libra, A. - Tichý, B. - Francová, H. - Vrbacky, F. - Smolej, L. - Mayer, J. - Bryja, Vítězslav - Doubek, M. - Pospíšilová, Š.
COBLL1, LPL and ZAP70 expression defines prognostic subgroups of chronic lymphocytic leukemia patients with high accuracy and correlates with IGHV mutational status.
Leukemia & Lymphoma. Roč. 58, č. 1 (2017), s. 70-79 ISSN 1042-8194
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: zap-70 expression * messenger-rna * cells
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Impakt faktor: 2.755, rok: 2016
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0269299

0476560 - BFU-R 2018 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Radaszkiewicz, K. A. - Sýkorová, Dominika - Binó, Lucia - Kudová, Jana - Bébarová, M. - Procházková, J. - Kotasová, H. - Kubala, Lukáš - Pacherník, J.
The acceleration of cardiomyogenesis in embryonic stem cells in vitro by serum depletion does not increase the number of developed cardiomyocytes.
PLoS ONE. Roč. 12, č. 3 (2017), č. článku e0173140. E-ISSN 1932-6203
Grant CEP: GA ČR GA13-29358S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: neural differentiation * retinoic acid * carcinoma-cells * defined medium
Kód oboru RIV: EB - Genetika a molekulární biologie
Impakt faktor: 2.806, rok: 2016
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0273035

0473579 - BFU-R 2018 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Renčiuk, Daniel - Ryneš, J. - Kejnovská, Iva - Foldynova-Trantirkova, S. - Andaeng, M. - Trantírek, L. - Vorlíčková, Michaela
G-quadruplex formation in the Oct4 promoter positively regulates Oct4 expression.
Biochimica et Biophysica Acta-Gene Regulatory Mechanisms. Roč. 1860, č. 2 (2017), s. 175-183 ISSN 1874-9399
Grant CEP: GA ČR(CZ) GP14-33947P; GA ČR GAP205/12/0466; GA ČR(CZ) GA15-06785S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: linked polymorphic region * guanine quadruplexes * transcription factor
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Impakt faktor: 5.018, rok: 2016
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0270707

0476152 - BFU-R 2018 RIV FR eng J - Článek v odborném periodiku
Sekelova, Z. - Štěpánová, H. - Polanský, O. - Varmužová, K. - Faldynová, M. - Fedr, Radek - Rychlík, I. - Vlasatiková, L.
Differential protein expression in chicken macrophages and heterophils in vivo following infection with Salmonella Enteritidis.
Veterinary Research. Roč. 48, JUN2017 (2017), č. článku 35. ISSN 0928-4249
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: endoplasmic-reticulum stress * messenger-rna expression * quantitative proteomics * internal control
Kód oboru RIV: GJ - Choroby a škůdci zvířat, veterinární medicína
Impakt faktor: 2.798, rok: 2016
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0272686

0479760 - UOCHB-X 2018 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Simonova, Anna - Havran, Luděk - Pohl, Radek - Fojta, Miroslav - Hocek, Michal
Phenothiazine-linked nucleosides and nucleotides for redox labelling of DNA.
Organic & Biomolecular Chemistry. Roč. 15, č. 33 (2017), s. 6984-6996 ISSN 1477-0520
Grant CEP: GA ČR GBP206/12/G151
AV ČR(CZ) AP1501
Akademická prémie - Praemium Academiae
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:68081707
Klíčová slova: electrochemical detection * primer extension * 2'-deoxyribonucleoside triphosphates
Kód oboru RIV: CC - Organická chemie
Impakt faktor: 3.564, rok: 2016
http://pubs.rsc.org/en/content/articlehtml/2017/ob/c7ob01439b
Fojta, Miroslav
- Hocek, Michal
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0275704

0476719 - BFU-R 2018 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Strmečki, S. - Trefulka, Mojmír - Zatloukalová, P. - Durech, M. - Vojtěšek, B. - Paleček, Emil
Immunoassays of chemically modified polysaccharides, glycans in glycoproteins and ribose in nucleic acids.
Analytica Chimica Acta. Roč. 955 (2017), s. 108-115 ISSN 0003-2670
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA15-15479S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: structural-characterization * voltammetric determination * electrochemical detection
Kód oboru RIV: CB - Analytická chemie, separace
Impakt faktor: 4.950, rok: 2016
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0273152

0475270 - UZFG-Y 2018 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Symonová, R. - Ocalewicz, K. - Kirtiklis, L. - Delmastro, G. B. - Pelikánová, Šárka - Garcia, S. - Kovařík, Aleš
Higher-order organisation of extremely amplified, potentially functional and massively methylated 5S rDNA in European pikes (Esox sp.).
BMC Genomics. Roč. 18, č. 391 (2017), č. článku 391. ISSN 1471-2164
Grant CEP: GA ČR GA14-02940S; GA ČR GBP501/12/G090
Institucionální podpora: RVO:67985904 ; RVO:68081707
Klíčová slova: rDNA * evolution * chromosome
Kód oboru RIV: EB - Genetika a molekulární biologie
Impakt faktor: 3.729, rok: 2016
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0272114

0476273 - BFU-R 2018 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Šponer, Jiří - Krepl, Miroslav - Banáš, P. - Kührová, P. - Zgarbová, M. - Jurečka, P. - Havrila, Marek - Otyepka, M.
How to understand atomistic molecular dynamics simulations of RNA and protein-RNA complexes?.
Wiley Interdisciplinary Reviews-RNA. Roč. 8, č. 3 (2017), č. článku e1405. ISSN 1757-7004
Grant CEP: GA ČR(CZ) GBP305/12/G034
GA MŠk(CZ) LO1305
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: hepatitis-delta-virus * amber force-field * free-energy landscape * hdv ribozyme
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Impakt faktor: 4.838, rok: 2016
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0272813

0476410 - BFU-R 2018 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Šponer, Judit E. - Šponer, Jiří - Di Mauro, E.
New evolutionary insights into the non-enzymatic origin of RNA oligomers.
Wiley Interdisciplinary Reviews-RNA. Roč. 8, č. 3 (2017), č. článku e1400. ISSN 1757-7004
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA14-12010S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: template-directed synthesis * citric-acid cycle * molecular-structure
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Impakt faktor: 4.838, rok: 2016
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0272920

0477358 - BFU-R 2018 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Tichý, Vlastimil - Šebest, Peter - Orság, Petr - Havran, Luděk - Pivoňková, Hana - Fojta, Miroslav
Protein p53 Binding to Cisplatin-modified DNA Targets Evaluated by Modification-specific Electrochemical Immunoprecipitation Assay.
Electroanalysis. Roč. 29, č. 2 (2017), s. 319-323 ISSN 1040-0397
Grant CEP: GA ČR GAP206/11/1638
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: catalytic hydrogen evolution * probe * mechanism * suggest
Kód oboru RIV: CG - Elektrochemie
Impakt faktor: 2.851, rok: 2016
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0273740

0476223 - BFU-R 2018 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Trefulka, Mojmír - Dorčák, Vlastimil - Křenková, Jana - Foret, František - Paleček, Emil
Electrochemical analysis of Os(VI)-modified glycoproteins and label-free glycoprotein detection eluted from lectin capillary column.
Electrochimica acta. Roč. 239, JUN 2017 (2017), s. 10-15 ISSN 0013-4686
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA15-15479S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: voltammetric determination * modified electrodes * high-sensitivity * concanavalin-a
Kód oboru RIV: CG - Elektrochemie; CG - Elektrochemie (UIACH-O)
Impakt faktor: 4.798, rok: 2016
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0272786

0471936 - BFU-R 2017 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Tylichová, Zuzana - Straková, Nicol - Vondráček, Jan - Vaculová, Alena - Kozubík, Alois - Hofmanová, Jiřina
Activation of autophagy and PPAR gamma protect colon cancer cells against apoptosis induced by interactive effects of butyrate and DHA in a cell type-dependent manner: The role of cell differentiation.
Journal of Nutritional Biochemistry. Roč. 39, JAN2017 (2017), s. 145-155 ISSN 0955-2863
Grant CEP: GA ČR GA13-09766S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: polyunsaturated fatty-acids * histone deacetylase inhibitors * docosahexaenoic acid
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Impakt faktor: 4.518, rok: 2016
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0269298

0471934 - BFU-R 2017 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Uzlíková, M. - Fulnečková, Jana - Weisz, F. - Sýkorová, Eva - Nohýnková, E. - Tůmová, P.
Characterization of telomeres and telomerase from the single-celled eukaryote Giardia intestinalis.
Molecular and Biochemical Parasitology. Roč. 211, JAN 2017 (2017), s. 31-38 ISSN 0166-6851
Grantová agentura ČR - GA ČR(CZ) GAP305/12/1248
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: trypanosoma-brucei * parasitic protozoa * 2 nuclei * lamblia * evolution * rna * organization
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Impakt faktor: 2.536, rok: 2016
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0269296

0476647 - BFU-R 2018 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Vereščáková, Hana - Ambrožová, Gabriela - Kubala, Lukáš - Perečko, Tomáš - Koudelka, Adolf - Vašíček, Ondřej - Rudolph, T.K. - Klinke, A. - Woodcock, S.R. - Freeman, B.A. - Pekarová, Michaela
Nitro-oleic acid regulates growth factor-induced differentiation of bone marrow-derived macrophages.
Free Radical Biology and Medicine. Roč. 104 (2017), s. 10-19 ISSN 0891-5849
Grant CEP: GA ČR GP13-40824P; GA ČR(CZ) GJ17-08066Y; GA MŠk(CZ) LD15069
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: colony-stimulating factor * nitrated fatty-acids * hematopoietic stem-cells * gm-csf
Kód oboru RIV: EB - Genetika a molekulární biologie
Impakt faktor: 5.606, rok: 2016
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0273112

0471935 - BFU-R 2017 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Vondráček, Jan - Pěnčíková, K. - Neca, J. - Ciganek, M. - Grycová, A. - Dvořák, Z. - Machala, M.
Assessment of the aryl hydrocarbon receptor-mediated activities of polycyclic aromatic hydrocarbons in a human cell-based reporter gene assay.
Environmental Pollution. Roč. 220, JAN2017 (2017), s. 307-316 ISSN 0269-7491
Grant CEP: GA ČR GA13-07711S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: rat primary hepatocytes * liver epithelial-cells * cancer-risk assessment
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Impakt faktor: 5.099, rok: 2016
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0269297

0476542 - BFU-R 2018 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Xu, A. - Tsanakopoulou, M. - Magnani, Ch.J. - Szabla, Rafal - Šponer, Judit E. - Šponer, Jiří - Gora, R.W. - Sutherland, J.D.
A prebiotically plausible synthesis of pyrimidine beta-ribonucleosides and their phosphate derivatives involving photoanomerization.
Nature Chemistry. Roč. 9, č. 4 (2017), s. 303-309 ISSN 1755-4330
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA14-12010S; GA MŠk(CZ) LQ1601
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: excited-state * 2-thiouracil * picture
Kód oboru RIV: CC - Organická chemie
Impakt faktor: 25.870, rok: 2016
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0273022

0476270 - BFU-R 2018 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Zapletal, Ondřej - Tylichová, Zuzana - Neča, J. - Kohoutek, J. - Machala, M. - Milcová, Alena - Pokorná, M. - Topinka, Jan - Moyer, M.P. - Hofmanová, Jiřina - Kozubík, Alois - Vondráček, Jan
Butyrate alters expression of cytochrome P450 1A1 and metabolism of benzo[a] pyrene via its histone deacetylase activity in colon epithelial cell models.
Archives of Toxicology. Roč. 91, č. 5 (2017), s. 2135-2150 ISSN 0340-5761
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA13-09766S; GA MŠk(CZ) LM2015073
Institucionální podpora: RVO:68081707 ; RVO:68378041
Klíčová slova: aryl-hydrocarbon receptor * polycyclic aromatic-hydrocarbons * beta-catenin
Kód oboru RIV: EB - Genetika a molekulární biologie; EB - Genetika a molekulární biologie (UEM-P)
Impakt faktor: 5.901, rok: 2016
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0272812

0477377 - BFU-R 2018 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Zgarbová, M. - Jurečka, P. - Lankaš, F. - Cheatham, T. E. - Sponer, Jiri - Otyepka, M.
Influence of BII Backbone Substates on DNA Twist: A Unified View and Comparison of Simulation and Experiment for All 136 Distinct Tetranucleotide Sequences.
Journal of Chemical Information and Modeling. Roč. 57, č. 2 (2017), s. 275-287 ISSN 1549-9596
Grant CEP: GA ČR(CZ) GP14-29874P
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: molecular-dynamics simulations * amber force-field * t-g-g * b-dna
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Impakt faktor: 3.760, rok: 2016
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0273870

0476549 - BFU-R 2018 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Zgarbová, M. - Jurečka, P. - Banáš, P. - Havrila, Marek - Šponer, Jiří - Otyepka, M.
Noncanonical alpha/gamma Backbone Conformations in RNA and the Accuracy of Their Description by the AMBER Force Field.
Journal of Physical Chemistry B. Roč. 121, č. 11 (2017), s. 2420-2433 ISSN 1520-6106
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: molecular-dynamics simulations * sugar-phosphate backbone * free-energy landscape * ribosomal-rna
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Impakt faktor: 3.177, rok: 2016
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0273031

0476154 - BFU-R 2018 US eng J - Článek v odborném periodiku
Zhou, J. - Amrane, S. - Rosu, F. - Salgado, G. - Bian, Y. - Tateishi-Karimata, H. - Largy, E. - Korkut, D. N. - Bourdoncle, A. - Miyoshi, D. - Zhang, J. - Ju, H. - Wang, W. - Sugimoto, N. - Gabelica, V. - Mergny, Jean-Louis
Unexpected Position-Dependent Effects of Ribose G-Quartets in G-Quadruplexes.
Journal of the American Chemical Society. Roč. 139, č. 23 (2017), s. 7768-7779 ISSN 0002-7863
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: human telomeric rna * electrospray mass-spectrometry * molecular crowding conditions * dna g-quadruplexes
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Impakt faktor: 13.858, rok: 2016
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0272687