Matonoha Ctirad

Publikace ASEP

RIV ID 8171556          

Označit vše / Zobrazit vše / Zrušit označení

Nalezeno záznamů: 15

0435849 - MBU-M 2015 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kaňa, Radek - Kotabová, Eva - Lukeš, Martin - Papáček, Š. - Matonoha, Ctirad - Liu, L.N. - Prášil, Ondřej - Mullineaux, C.W.
Phycobilisome Mobility and Its Role in the Regulation of Light Harvesting in Red Algae.
Plant Physiology. Roč. 165, č. 4 (2014), s. 1618-1631. ISSN 0032-0889
Grant CEP: GA ČR GAP501/12/0304; GA MŠk ED2.1.00/03.0110
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:67985807
Klíčová slova: EXCITATION-ENERGY TRANSFER * CYANOBACTERIAL THYLAKOID MEMBRANES * MICROALGA PORPHYRIDIUM-CRUENTUM
Kód oboru RIV: EE - Mikrobiologie, virologie; BA - Obecná matematika (UIVT-O)
Impakt faktor: 6.841, rok: 2014
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0239776

0492042 - UIVT-O 2019 RIV CH eng C - Konferenční příspěvek (zahraniční konf.)
Matonoha, Ctirad - Papáček, Š. - Kindermann, S.
Disc vs. Annulus: On the Bleaching Pattern Optimization for FRAP Experiments.
High Performance Computing in Science and Engineering - HPCSE 2017. Cham: Springer, 2018 - (Kozubek, T.; Čermák, M.; Tichý, P.; Blaheta, R.; Šístek, J.; Lukáš, D.; Jaroš, J.), s. 160-173. Lecture Notes in Computer Science, 11087. ISBN 978-3-319-97135-3. ISSN 0302-9743.
[HPCSE 2017: International Conference on High Performance Computing in Science and Engineering /3./. Karolinka (CZ), 22.05.2017-25.05.2017]
CENAKVA(CZ) CZ.1.05/2.1.00/01.0024; GA MŠk(CZ) LO1205; CENAKVA(CZ) CZ.1.05/2.1.00/19.0380
Institucionální podpora: RVO:67985807
Klíčová slova: Optimization * Parameter identification * FRAP Bleaching pattern * Initial boundary value problem * Sensitivity measure
Kód oboru RIV: BA - Obecná matematika
Obor OECD: Pure mathematics
Matonoha, Ctirad
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0285620

0442759 - UIVT-O 2015 RIV ES eng C - Konferenční příspěvek (zahraniční konf.)
Matonoha, Ctirad - Papáček, Š.
On the Connection and Equivalence of Two Methods for Solving an Ill-Posed Inverse Problem Based on FRAP Data.
Modelling for Engineering and Human Behaviour 2014. Valencia: Universitat Politecnica de Valencia, 2014 - (Jódar, L.; Acedo, L.; Cortés, J.; Torregrosa, J.), s. 102-105. ISBN 978-84-606-5746-0.
[Mathematical Modelling for Engineering and Human Behaviour 2014. Valencia (ES), 03.09.2014-05.09.2014]
Institucionální podpora: RVO:67985807
Klíčová slova: inverse problem * parameter identification * Tikhonov regularization * optimization * least squares with a quadratic constraint * L-curve * FRAP
Kód oboru RIV: BA - Obecná matematika
http://jornadas.imm.upv.es/Modelling2014
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0245599

0445719 - UIVT-O 2016 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Matonoha, Ctirad - Papáček, Š.
On the Connection and Equivalence of Two Methods for Solving an ill-posed Inverse Problem Based on FRAP Data.
Journal of Computational and Applied Mathematics. Roč. 290, 15 December (2015), s. 598-608. ISSN 0377-0427
GA MŠk(CZ) ED2.1.00/01.0024; GA MŠk(CZ) LO1205
Institucionální podpora: RVO:67985807
Klíčová slova: inverse problem * parameter identification * Tikhonov regularization * least squares with a quadratic constraint * L-curve * FRAP
Kód oboru RIV: BA - Obecná matematika
Impakt faktor: 1.328, rok: 2015
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0247781

Citace, recenze

Citace:
PAN, H. - ZOU, T. - YU, H.B. - DU, D.W. Analysis and correction of ill-conditioned model in multivariable model predictive control. INTERNATIONAL JOURNAL OF MODELLING IDENTIFICATION AND CONTROL. ISSN 1746-6172, 2016, vol. 26, no. 2, p. 130-139.

0473651 - UIVT-O 2018 CZ eng K - Konferenční příspěvek (tuzemská konf.)
Matonoha, Ctirad - Papáček, Š.
On the optimal initial conditions for an inverse problem of model parameter estimation.
SNA´17 - Seminar on Numerical Analysis. Ostrava: Ústav geoniky AV ČR, 2017 - (Blaheta, R.; Starý, J.), s. 72-75. ISBN 978-80-86407-64-7.
[SNA ’17. Seminar on Numerical Analysis. Ostrava (CZ), 30.01.2017-03.02.2017]
GA MŠk(CZ) ED2.1.00/01.0024; GA MŠk(CZ) LO1205
Institucionální podpora: RVO:67985807
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0270784

0476436 - UIVT-O 2018 RIV CZ eng C - Konferenční příspěvek (zahraniční konf.)
Matonoha, Ctirad - Papáček, Š. - Kindermann, S.
On the Optimization of Initial Conditions for a Model Parameter Estimation.
Programs and algorithms of numerical mathematics 18. Prague: Institute of Mathematics CAS, 2017 - (Chleboun, J.; Kůs, P.; Přikryl, P.; Segeth, K.; Šístek, J.; Vejchodský, T.), s. 73-80. ISBN 978-80-85823-67-7.
[Programs and Algorithms of Numerical Mathematics /18./. Janov nad Nisou (CZ), 19.06.2016-24.06.2016]
GA MŠk(CZ) ED2.1.00/01.0024; GA MŠk(CZ) LO1205
Institucionální podpora: RVO:67985807
Klíčová slova: FRAP * sensitivity analysis * optimal experimental design * parameter estimation * finite differences
Kód oboru RIV: BA - Obecná matematika
Obor OECD: Applied mathematics
http://hdl.handle.net/10338.dmlcz/703000
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0272938

0425467 - UIVT-O 2014 CZ eng K - Konferenční příspěvek (tuzemská konf.)
Matonoha, Ctirad - Papáček, Š.
On three equivalent methods for parameter estimation problem based on spatio-temporal FRAP data.
SNA´14 - Seminar on Numerical Analysis. Praha: Institute of Computer Science AS CR, 2014 - (Bílková, H.; Rozložník, M.; Tichý, P.), s. 78-82. ISBN 978-80-87136-16-4.
[SNA ’14. Seminar on Numerical Analysis. Nymburk (CZ), 27.01.2014-31.01.2014]
GA MŠk(CZ) ED2.1.00/01.0024; GA MŠk LO1205
Institucionální podpora: RVO:67985807
Klíčová slova: inverse problem formulation * Tikhonov regularizaton * least-squares problem
Kód oboru RIV: BA - Obecná matematika
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0231340

0459275 - UIVT-O 2017 RIV CH eng C - Konferenční příspěvek (zahraniční konf.)
Matonoha, Ctirad - Papáček, Š.
Parameter Identification Problem Based on FRAP Images: From Data Processing to Optimal Design of Photobleaching Experiments.
High Performance Computing in Science and Engineering. Cham: Springer, 2016 - (Kozubek, T.; Blaheta, R.; Šístek, R.; Rozložník, M.; Čermák, M.), s. 186-195. Lecture Notes in Computer Science, 9611. ISBN 978-3-319-40360-1. ISSN 0302-9743.
[HPCSE 2015. High Performance Computing in Science and Engineering /2./. Soláň - Beskydy (CZ), 25.05.2015-28.05.2015]
GA MŠk(CZ) ED2.1.00/01.0024; GA MŠk(CZ) LO1205
Institucionální podpora: RVO:67985807
Klíčová slova: FRAP * optimal experimental design * sensitivity analysis * parameter identification
Kód oboru RIV: BA - Obecná matematika
Matonoha, Ctirad
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0259501

0443344 - UIVT-O 2016 CZ eng K - Konferenční příspěvek (tuzemská konf.)
Matonoha, Ctirad - Papáček, Š.
Synergy between the Parameter Estimation and a Design Variable Optimization for FRAP Experiments.
SNA´15 - Seminar on Numerical Analysis. Ostrava: Institute of Geonics AS CR, 2015, s. 82-85. ISBN 978-80-86407-55-5.
[SNA ’15. Seminar on Numerical Analysis. Ostrava (CZ), 19.01.2015-23.01.2015]
GA MŠk(CZ) ED2.1.00/01.0024; GA MŠk LO1205
Institucionální podpora: RVO:67985807
Kód oboru RIV: BA - Obecná matematika
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0246073

0457696 - UIVT-O 2016 RIV ES eng C - Konferenční příspěvek (zahraniční konf.)
Papáček, Š. - Macdonald, B. - Matonoha, Ctirad
Closed-form Formulae vs. PDE Based Numerical Solution for FRAP Data Processing: Theoretical and Practical Comparison.
Modelling for Engineering and Human Behaviour 2015. Valencia: Universitat Politecnica de Valencia, 2015 - (Jódar, L.; Acedo, L.; Cortés, J.; Torregrosa, J.), s. 359-364. ISBN 978-84-608-5355-8.
[Mathematical Modelling for Engineering and Human Behaviour 2015. Valencia (ES), 09.09.2015-11.09.2015]
GA MŠk(CZ) ED2.1.00/01.0024; GA MŠk(CZ) LO1205
Institucionální podpora: RVO:67985807
Klíčová slova: fluorescence recovery after photobleaching (FRAP) * parameter estimation * sensitivity analysis * partial differential equation (PDE)
Kód oboru RIV: BA - Obecná matematika
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0258070

0473666 - UIVT-O 2018 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Papáček, Š. - Macdonald, B. - Matonoha, Ctirad
Closed-Form Formulas vs. PDE Based Numerical Solution for the FRAP Data Processing: Theoretical and Practical Comparison.
Computers & Mathematics With Applications. Roč. 73, č. 8 (2017), s. 1673-1683. ISSN 0898-1221
GA MŠk(CZ) ED2.1.00/01.0024; GA MŠk(CZ) LO1205
Institucionální podpora: RVO:67985807
Klíčová slova: fluorescence recovery after photobleaching (FRAP) * parameter estimation * sensitivity analysis * partial differential equation (PDE)
Kód oboru RIV: BA - Obecná matematika
Obor OECD: Applied mathematics
Impakt faktor: 1.860, rok: 2017
Matonoha, Ctirad
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0270797

0443270 - UIVT-O 2016 RIV CH eng C - Konferenční příspěvek (zahraniční konf.)
Papáček, Š. - Jablonský, J. - Matonoha, Ctirad - Kaňa, Radek - Kindermann, S.
FRAP & FLIP: Two Sides of the Same Coin?
Bioinformatics and Biomedical Engineering, Part II. Vol. 2. Cham: Springer, 2015 - (Ortuno, F.; Rojas, I.), s. 444-455. Lecture Notes in Bioinformatics, 9044. ISBN 978-3-319-16479-3. ISSN 0302-9743.
[IWBBIO 2015. International Conference /3./. Granada (ES), 15.04.2015-17.04.2015]
Grant CEP: GA MŠk LO1416; GA ČR GAP501/12/0304
GA MŠk(CZ) ED2.1.00/01.0024; GA MŠk(CZ) LO1205; GA MŠk(CZ) EE2.3.30.0006; GA TA ČR(CZ) TA01010214
Institucionální podpora: RVO:67985807 ; RVO:61388971
Klíčová slova: FRAP * FLIP * sensitivity analysis * parameter identification
Kód oboru RIV: BA - Obecná matematika; BA - Obecná matematika (MBU-M)
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0246004

0432206 - UTIA-B 2015 RIV CH eng C - Konferenční příspěvek (zahraniční konf.)
Papáček, Š. - Jablonský, J. - Petera, K. - Rehák, Branislav - Matonoha, Ctirad
Modeling and Optimization of Microalgae Growth in Photobioreactors: A Multidisciplinary Problem.
ISCS 2014: Interdisciplinary Symposium on Complex Systems. Vol. Part III. Cham: Springer, 2014 - (Sanayei, A.; Rossler, E.; Zelinka, I.), s. 277-286. Emergence, Complexity and Computation ECC, 14. ISBN 978-3-319-10758-5. ISSN 2194-7287.
[ISCS 2014: The Interdisciplinary Symposium on Complex Systems. Florencie (IT), 15.09.2014-18.09.2014]
Institucionální podpora: RVO:67985556 ; RVO:67985807
Klíčová slova: Microalgae * photobioreactor * optimization * multiscale modeling * flashing light effect
Kód oboru RIV: BC - Teorie a systémy řízení; BA - Obecná matematika (UIVT-O)
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0236720

0492044 - UIVT-O 2019 RIV CH eng C - Konferenční příspěvek (zahraniční konf.)
Papáček, Š. - Matonoha, Ctirad - Petera, K.
Modeling and Simulation of Microalgae Growth in a Couette-Taylor Bioreactor.
High Performance Computing in Science and Engineering - HPCSE 2017. Cham: Springer, 2018 - (Kozubek, T.; Čermák, M.; Tichý, P.; Blaheta, R.; Šístek, J.; Lukáš, D.; Jaroš, J.), s. 174-187. Lecture Notes in Computer Science, 11087. ISBN 978-3-319-97135-3. ISSN 0302-9743.
[HPCSE 2017: International Conference on High Performance Computing in Science and Engineering /3./. Karolinka (CZ), 22.05.2017-25.05.2017]
CENAKVA(CZ) CZ.1.05/2.1.00/01.0024; GA MŠk(CZ) LO1205; CENAKVA(CZ) CZ.1.05/2.1.00/19.0380
Institucionální podpora: RVO:67985807
Klíčová slova: Microalgae * Mathematical modeling * Photosynthesis * CFD * Couette-Taylor bioreactor * Flashing light enhancement
Kód oboru RIV: BA - Obecná matematika
Obor OECD: Pure mathematics
Matonoha, Ctirad
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0285622

0444130 - UIVT-O 2016 RIV CZ eng C - Konferenční příspěvek (zahraniční konf.)
Papáček, Š. - Jablonský, J. - Matonoha, Ctirad
On Two Methods for the Parameter Estimation Problem with Spatio-Temporal FRAP Data.
Programs and algorithms of numerical mathematics 17. Proceedings of seminar. Praha: Matematický ústav AV ČR, v.v.i, 2015 - (Chleboun, J.; Přikryl, P.; Segeth, K.; Šístek, J.; Vejchodský, T.), s. 163-168. ISBN 978-80-85823-64-6.
[Programs and Algorithms of Numerical Mathematics /17./. Dolní Maxov (CZ), 08.06.2014-13.06.2014]
GA MŠk(CZ) ED2.1.00/01.0024; GA MŠk(CZ) LO1205; GA MŠk(CZ) EE2.3.30.0006
Institucionální podpora: RVO:67985807
Klíčová slova: parameter estimation * fluorescence recovery after photobleaching * diffusion equation * Moullineaux method * Fisher information matrix * sensitivity analysis * confidence intervals * uncertainty quantification
Kód oboru RIV: BA - Obecná matematika
http://dml.cz/handle/10338.dmlcz/702679
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0246708