Cwiklik Lukasz

Publikace ASEP

     

Označit vše / Zobrazit vše / Zrušit označení

Nalezeno záznamů: 26

0499044 - UFCH-W 2019 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Baig, Mirza Wasif - Jurkiewicz, Piotr - Cwiklik, Lukasz - Pittner, Jiří
Orientation of Laurdan in Phospholipid Bilayers Influences Its Fluorescence: Quantum Mechanics and Classical Molecular Dynamics Study.
Molecules. Roč. 23, č. 7 (2018), č. článku 1707. ISSN 1420-3049
Grant CEP: GA ČR(CZ) GAP208/12/0559; GA ČR(CZ) GA18-26751S
Institucionální podpora: RVO:61388955
Klíčová slova: water * simulation * vesicles * program * prodan * model * fluorescence
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 3.098, rok: 2017
Pittner, Jiří
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0291334

0475201 - UEB-Q 2018 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Bilkova, E. - Pleskot, Roman - Rissanen, S. - Sun, S. - Czogalla, A. - Cwiklik, Lukasz - Róg, T. - Vattulainen, I. - Cremer, P. S. - Jungwirth, P. - Coskun, U.
Calcium Directly Regulates Phosphatidylinositol 4,5-Bisphosphate Headgroup Conformation and Recognition.
Journal of the American Chemical Society. Roč. 139, č. 11 (2017), s. 4019-4024. ISSN 0002-7863
Grant CEP: GA ČR GA13-19073S
Institucionální podpora: RVO:61389030 ; RVO:61388955
Klíčová slova: membrane * calcium ions * PIP2 * molecular dynamics
Kód oboru RIV: EB - Genetika a molekulární biologie; CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie (UFCH-W)
Obor OECD: Cell biology
Impakt faktor: 14.357, rok: 2017
Cremer, P. S.
- Jungwirth, P.
- Coskun, U.
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0272052

0469864 - UEB-Q 2017 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Bloch, D. - Pleskot, Roman - Pejchar, Přemysl - Potocký, Martin - Trpkošová, Pavlína - Cwiklik, Lukasz - Vukašinović, Nemanja - Sternberg, H. - Yalovsky, S. - Žárský, Viktor
Exocyst SEC3 and Phosphoinositides Define Sites of Exocytosis in Pollen Tube Initiation and Growth.
Plant Physiology. Roč. 172, č. 2 (2016), s. 980-1002. ISSN 0032-0889
Grant CEP: GA ČR GA13-19073S
Institucionální podpora: RVO:61389030 ; RVO:61388955
Klíčová slova: polar cell-growth * arabidopsis-thaliana * plasma-membrane * vesicle trafficking * affects endocytosis * subunit sec3 * force-field * tip growth * complex * tobacco
Kód oboru RIV: EB - Genetika a molekulární biologie; CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie (UFCH-W)
Impakt faktor: 6.456, rok: 2016
Yalovsky, S.
- Žárský, Viktor
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0267641

0498437 - UFCH-W 2019 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Cebecauer, Marek - Amaro, Mariana - Jurkiewicz, Piotr - Sarmento, Maria Joäo - Šachl, Radek - Cwiklik, Lukasz - Hof, Martin
Membrane Lipid Nanodomains.
Chemical Reviews. Roč. 118, č. 23 (2018), s. 11259-11297. ISSN 0009-2665
Grant CEP: GA ČR GA17-03160S
Institucionální podpora: RVO:61388955
Klíčová slova: membranes * nanomaterials * lipids
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 52.613, rok: 2017

Cebecauer, Marek Hof, Martin
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0290809

0468631 - UFCH-W 2017 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Cwiklik, Lukasz
Tear film lipid layer: A molecular level view.
Biochimica Et Biophysica Acta-Biomembranes. Roč. 1858, č. 10 (2016), s. 2421-2430. ISSN 0005-2736
Grant CEP: GA ČR GA15-14292S
Institucionální podpora: RVO:61388955
Klíčová slova: tear film * tear film lipid layer * molecular dynamics simulations
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 3.498, rok: 2016
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0266436

0429619 - UFCH-W 2015 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Först, G. - Cwiklik, Lukasz - Jurkiewicz, Piotr - Schubert, R. - Hof, Martin
Interactions of beta-blockers with model lipid membranes: Molecular view of the interaction of acebutolol, oxprenolol, and propranolol with phosphatidylcholine vesicles by time-dependent fluorescence shift and molecular dynamics simulations.
European Journal of Pharmaceutics and Biopharmaceutics. Roč. 87, č. 3 (2014), s. 559-569. ISSN 0939-6411
Grant CEP: GA ČR GBP208/12/G016
Institucionální podpora: RVO:61388955
Klíčová slova: Drug-membrane interactions * Dtmac * Generalized polarization
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 3.383, rok: 2014
Jurkiewicz, Piotr
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0234697

0477823 - UFCH-W 2018 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Golda-Cepa, M. - Kulig, W. - Cwiklik, Lukasz - Kotarba, A.
Molecular Dynamics Insights into Water-Parylene C Interface: Relevance of Oxygen Plasma Treatment for Biocompatibility.
ACS Applied Materials and Interfaces. Roč. 9, č. 19 (2017), s. 16685-16693. ISSN 1944-8244
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA17-06792S
Institucionální podpora: RVO:61388955
Klíčová slova: molecular dynamics * contact angle * surface free energy * parylene C * biomaterials oxygen plasma
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 8.097, rok: 2017
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0274047

0446772 - UFCH-W 2016 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Griffith, E. C. - Perkins, R.J. - Telesford, D.-M. - Adams, E. M. - Cwiklik, Lukasz - Allen, H. C. - Roeselová, Martina - Vaida, V.
Interaction of L-Phenylalanine with a Phospholipid Monolayer at the Water−Air Interface.
Journal of Physical Chemistry B. Roč. 119, č. 29 (2015), s. 9038-9048. ISSN 1520-6106
Grant CEP: GA ČR GA13-06181S
Institucionální podpora: RVO:61388955 ; RVO:61388963
Klíčová slova: SUM-FREQUENCY GENERATION * BREWSTER-ANGLE MICROSCOPY * INTRINSICALLY UNSTRUCTURED PROTEINS
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 3.187, rok: 2015
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0248742

0453441 - UOCHB-X 2016 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Habartová, Alena - Roeselová, Martina - Cwiklik, Lukasz
Investigation of Mixed Surfactant Films at Water Surface Using Molecular Dynamics Simulations.
Langmuir. Roč. 31, č. 42 (2015), s. 11508-11515. ISSN 0743-7463
Grant CEP: GA ČR GA13-06181S
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:61388955
Klíčová slova: Langmuir monolayers * acid monolayers * potentials
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 3.993, rok: 2015
Cwiklik, Lukasz
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0254253

0489866 - UFCH-W 2019 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Javanainen, M. - Lamberg, A. - Cwiklik, Lukasz - Vattulainen, I. - Ollila, O. H. S.
Atomistic Model for Nearly Quantitative Simulations of Langmuir Monolayers.
Langmuir. Roč. 34, č. 7 (2018), s. 2565-2572. ISSN 0743-7463
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA17-06792S
Institucionální podpora: RVO:61388955
Klíčová slova: Atomistic molecular dynamics simulations * Bioinformatics * fluid lipid layer
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 3.789, rok: 2017
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0284184

0487732 - UFCH-W 2019 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kulig, W. - Mikkolainen, H. - Olžyńska, Agnieszka - Jurkiewicz, Piotr - Cwiklik, Lukasz - Hof, Martin - Vattulainen, I. - Jungwirth, P. - Rog, T.
Bobbing of Oxysterols: Molecular Mechanism for Translocation of Tail-Oxidized Sterols through Biological Membranes.
Journal of Physical Chemistry Letters. Roč. 9, č. 5 (2018), s. 1118-1123. ISSN 1948-7185
Grant CEP: GA ČR(CZ) GBP208/12/G016; GA MŠk(CZ) EF16_019/0000729
Institucionální podpora: RVO:61388955
Klíčová slova: biological membranes * alcohols * cell membranes
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 8.709, rok: 2017
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0282365

0468638 - UFCH-W 2017 RIV IE eng J - Článek v odborném periodiku
Kulig, W. - Cwiklik, Lukasz - Jurkiewicz, Piotr - Rog, T. - Vattulainen, I.
Cholesterol oxidation products and their biological importance.
Chemistry and Physics of Lipids. Roč. 199, SI (2016), s. 144-160. ISSN 0009-3084
Grant CEP: GA ČR(CZ) GBP208/12/G016; GA ČR GA15-14292S
Institucionální podpora: RVO:61388955
Klíčová slova: cholesterol * oxidation * oxysterols
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 3.361, rok: 2016
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0266444

0443291 - UFCH-W 2016 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kulig, W. - Olžyńska, Agnieszka - Jurkiewicz, Piotr - Kantola, A. M. - Komulainen, S. - Manna, M. - Pourmousa, M. - Vazdar, M. - Cwiklik, Lukasz - Rog, T. - Khelashvili, G. - Harries, D. - Telkki, V. - V. - Hof, Martin - Vattulainen, I. - Jungwirth, Pavel
Cholesterol under oxidative stress — How lipid membranes sense oxidation as cholesterol is being replaced by oxysterols.
Free Radical Biology and Medicine. Roč. 84, JUL 2015 (2015), s. 30-41. ISSN 0891-5849
Grant CEP: GA ČR GBP208/12/G016
Institucionální podpora: RVO:61388955 ; RVO:61388963
Klíčová slova: phospholipid bilayers * oxysterols * molecular dynamics simulations
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 5.784, rok: 2015
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0246022

0485404 - UFCH-W 2018 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Licari, G. - Cwiklik, Lukasz - Jungwirth, Pavel - Vauthey, E.
Exploring Fluorescent Dyes at Biomimetic Interfaces with Second Harmonic Generation and Molecular Dynamics.
Langmuir. Roč. 33, č. 14 (2017), s. 3373-3383. ISSN 0743-7463
Grant CEP: GA ČR(CZ) GBP208/12/G016
Institucionální podpora: RVO:61388955 ; RVO:61388963
Klíčová slova: sum-frequency generation * excited-state dynamics * air-water-interface * density-functional theory
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 3.789, rok: 2017
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0280432

0466352 - UFCH-W 2017 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Melcrová, Adéla - Pokorná, Šárka - Pullanchery, S. - Kohagen, Miriam - Jurkiewicz, Piotr - Hof, Martin - Jungwirth, Pavel - Cremer, P. S. - Cwiklik, Lukasz
The complex nature of calcium cation interactions with phospholipid bilayers.
Scientific Reports. Roč. 6, DEC 2016 (2016), č. článku 38035. ISSN 2045-2322
Grant CEP: GA ČR(CZ) GBP208/12/G016; GA ČR(CZ) GA16-01074S
Institucionální podpora: RVO:61388955 ; RVO:61388963
Klíčová slova: FLUORESCENCE SOLVENT RELAXATION * MOLECULAR-DYNAMICS SIMULATIONS * ALKALINE-EARTH CATIONS
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 4.259, rok: 2016
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0264672

0453451 - UOCHB-X 2016 RIV CZ eng J - Článek v odborném periodiku
Nikouee, A. - Khabiri, Morteza - Cwiklik, Lukasz
Scorpion toxins prefer salt solutions.
Journal of Molecular Modeling. Roč. 21, č. 11 (2015), 287/1-287/14. ISSN 1610-2940
Grant CEP: GA ČR GA13-06181S
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:61388955
Klíčová slova: ionic solutions * molecular dynamics * nonaqueous media * secondary structure
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 1.438, rok: 2015
Khabiri, Morteza
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0254258

0497636 - UFCH-W 2019 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Olšinová, Marie - Jurkiewicz, Piotr - Kishko, Irina - Sýkora, Jan - Sabó, Ján - Hof, Martin - Cwiklik, Lukasz - Cebecauer, Marek
Roughness of Transmembrane Helices Reduces Lipid Membrane Dynamics.
iScience. Roč. 10, DEC 2018 (2018), s. 87-97. E-ISSN 2589-0042
Grant CEP: GA ČR GAP305/11/0459; GA ČR(CZ) GBP208/12/G016; GA ČR(CZ) GA18-26751S
GA MŠk(CZ) LM2015042
Institucionální podpora: RVO:61388955
Klíčová slova: LATERAL DIFFUSION * HYDROPHOBIC MISMATCH * PROTEIN INTERACTIONS
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Obor OECD: Physical chemistry
Cebecauer, Marek
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0290177

0477822 - UFCH-W 2018 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Olžyńska, Agnieszka - Cwiklik, Lukasz
Behavior of sphingomyelin and ceramide in a tear film lipid layer model.
Annals of Anatomy-Anatomischer Anzeiger. Roč. 210, MAR 2017 (2017), s. 128-134. ISSN 0940-9602
Grant CEP: GA ČR GA15-14292S
Institucionální podpora: RVO:61388955
Klíčová slova: Molecular dynamics simulations * Sphingomyelin * Tear film lipid layer
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 1.852, rok: 2017
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0274045

0468645 - UFCH-W 2017 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Olžyńska, Agnieszka - Zubek, M. - Roeselová, Martina - Korchowiec, J. - Cwiklik, Lukasz
Mixed DPPC/POPC Monolayers: All-atom Molecular Dynamics Simulations and Langmuir Monolayer Experiments.
Biochimica Et Biophysica Acta-Biomembranes. Roč. 1858, č. 12 (2016), s. 3120-3130. ISSN 0005-2736
Grant CEP: GA ČR GA15-14292S
Institucionální podpora: RVO:61388955 ; RVO:61388963
Klíčová slova: phospholipid monolayers * Lung surfactant * molecular dynamics
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 3.498, rok: 2016
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0266455

0431078 - UFCH-W 2015 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Pederzoli, Marek - Sobek, Lukáš - Brabec, Jiří - Kowalski, K. - Cwiklik, Lukasz - Pittner, Jiří
Fluorescence of PRODAN in water: A computational QM/MM MD study.
Chemical Physics Letters. Roč. 597, MAR 2014 (2014), s. 57-62. ISSN 0009-2614
Grant CEP: GA ČR(CZ) GAP208/12/0559
Institucionální podpora: RVO:61388955
Klíčová slova: Emission spectroscopy * Excited states * Molecular dynamics
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 1.897, rok: 2014
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0235712

0468642 - UFCH-W 2017 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Perkins, R.J. - Kukharchuk, Alexandra - Delcroix, Pauline - Shoemaker, R. K. - Roeselová, Martina - Cwiklik, Lukasz - Vaida, V.
The Partitioning of Small Aromatic Molecules to Air-Water and Phospholipid Interfaces Mediated by Non-Hydrophobic Interactions.
Journal of Physical Chemistry B. Roč. 120, č. 30 (2016), s. 7408-7422. ISSN 1520-6106
Grant CEP: GA ČR GA15-14292S
Institucionální podpora: RVO:61388955 ; RVO:61388963
Klíčová slova: Nuclear magnetic resonance spectroscopy * Biological systems * Mass spectrometry
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 3.177, rok: 2016
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0266450

0446791 - UEB-Q 2016 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Pleskot, Roman - Cwiklik, Lukasz - Jungwirth, Pavel - Žárský, Viktor - Potocký, Martin
Membrane targeting of the yeast exocyst complex.
Biochimica Et Biophysica Acta-Biomembranes. Roč. 1848, č. 7 (2015), s. 1481-1489. ISSN 0005-2736
Grant CEP: GA ČR GA13-19073S; GA ČR GBP208/12/G016
GA MŠk(CZ) LO1417
Institucionální podpora: RVO:61389030 ; RVO:61388955 ; RVO:61388963
Klíčová slova: The exocyst complex * Exo70p * Sec3p
Kód oboru RIV: EB - Genetika a molekulární biologie; CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie (UFCH-W)
Impakt faktor: 3.687, rok: 2015

Pleskot, Roman Potocký, Martin
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0248755

0475164 - UOCHB-X 2018 RIV IE eng J - Článek v odborném periodiku
Riedlová, Kamila - Nekardová, Michaela - Kačer, P. - Syslová, K. - Vazdar, M. - Jungwirth, Pavel - Kudová, Eva - Cwiklik, Lukasz
Distributions of therapeutically promising neurosteroids in cellular membranes.
Chemistry and Physics of Lipids. Roč. 203, Mar (2017), s. 78-86. ISSN 0009-3084
Grant CEP: GA TA ČR(CZ) TE01020028; GA ČR(CZ) GAP303/12/1464; GA ČR GA15-14292S; GA ČR(CZ) GBP208/12/G016
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:61388955
Klíčová slova: steroids * N-methyl-D-aspartate receptors * membranes * molecular dynamics * chromatography
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie; CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie (UFCH-W)
Obor OECD: Physical chemistry; Physical chemistry (UFCH-W)
Impakt faktor: 2.766, rok: 2017
Kudová, Eva
- Cwiklik, Lukasz
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0272677

0431198 - UFCH-W 2015 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Stetter, F. W. - Cwiklik, Lukasz - Jungwirth, Pavel - Hugel, T.
Single Lipid Extraction: The Anchoring Strength of Cholesterol in Liquid- Ordered and Liquid-Disordered Phases.
Biophysical Journal. Roč. 107, č. 5 (2014), s. 1167-1175. ISSN 0006-3495
Grant CEP: GA ČR GBP208/12/G016
Institucionální podpora: RVO:61388955 ; RVO:61388963
Klíčová slova: MOLECULAR-DYNAMICS METHOD * ATOMIC-FORCE MICROSCOPY * SUPPORTED MEMBRANES
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 3.972, rok: 2014
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0235793

0427792 - UFCH-W 2015 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Štefl, Martin - Šachl, Radek - Olžyńska, Agnieszka - Amaro, Mariana - Savchenko, Dariia - Deyneka, Alexander - Hermetter, A. - Cwiklik, Lukasz - Humpolíčková, Jana - Hof, Martin
Comprehensive portrait of cholesterol containing oxidized membrane.
Biochimica Et Biophysica Acta-Biomembranes. Roč. 1838, č. 7 (2014), s. 1769-1776. ISSN 0005-2736
Grant CEP: GA ČR GBP208/12/G016; GA MŠk LH13259
SAFMAT(CZ) CZ.2. 13/3.1.00/22132
Institucionální podpora: RVO:61388955 ; RVO:68378271
Klíčová slova: oxidized lipids * lateral diffusion * molecular dynamics simulations
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 3.836, rok: 2014
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0233275

0427289 - UFCH-W 2015 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Wizert, A. - Iskander, D. R. - Cwiklik, Lukasz
Organization of Lipids in the Tear Film: A Molecular- Level View.
PLoS ONE. Roč. 9, č. 3 (2014), e92461. E-ISSN 1932-6203
Institucionální podpora: RVO:61388955
Klíčová slova: DRY EYE DISEASE * CONTACT-LENS WEARERS * COARSE-GRAINED MODEL
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 3.234, rok: 2014
Trvalý odkaz: http://hdl.handle.net/11104/0232879